一，首先医疗物品和原始材料的保管，会在患者与医院发生医疗纠纷后，投诉到医疗单位要求处理的时候进行封存和妥善保管。
二，展开调查后出示调查报告的工作是由医疗行政管理部门完成的，如果纠纷涉及到乡村医生或者个体医疗机构则由批准审核部门对其进行处理和调查。调查对象为：病人，家属，当事人，旁观人。
三，对医疗文书，技术，相关法规，相关制度进行调查，咨询，熟悉。
四，医务部在调查后与病人协商，如不能达成一致，则由医疗纠纷调查小组进行研究，给出处理意见，协调解决，上报上级行政部门。
五，医疗纠纷未能在调查小组与患者的协商中得到解决，可以通过三级医疗事故鉴定委员会给出鉴定结论，不服可申请复议或起诉。鉴定程序为组织鉴定为约会成员会议，通报情况和具体制度法规了解，对病例资料以及相关证据进行鉴定和调查，给出结论，发布鉴定书。
六，进入诉讼，提交起诉状，得到法院受理，立案通知后做开庭准备。原告如有对证据或财产保全的措施申请这个时候要及时申请。
七，开庭审理。法庭调解不适应针对行政案件。合议庭评议后宣判。
当医疗纠纷发生患者或者家属可以不必要经过双方的调解，协商，或者请求行政部门来处理等环节，直接向人民法院提起诉讼也是医疗纠纷处理的程序。